Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR1D2Q14995 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms