Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTTNQ14247 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms