Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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