Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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SHROOM2Q13796 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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