Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms