Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFCP2Q12800 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFCP2Q12800 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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