Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms