Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms