Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6Q03468 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6Q03468 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms