Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms