Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms