Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P61574 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms