Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1P51787 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms