Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms