Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP2P42575 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP2P42575 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP2P42575 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms