Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRGP23470 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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