Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms