Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A1P19634 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms