Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGAM1P18669 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms