Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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