Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHN1P15882 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHN1P15882 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHN1P15882 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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