Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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