Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APODP05090 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APODP05090 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms