Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNB1P01574 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms