Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCTN3O75935 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms