Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP11Q9Y3A2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms