Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRPF3Q9ULD4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms