Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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