Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms