Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EMILIN3Q9NT22 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EMILIN3Q9NT22 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms