Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms