Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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FOXP3Q9BZS1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FOXP3Q9BZS1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FOXP3Q9BZS1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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