Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NUP58Q9BVL2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NUP58Q9BVL2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms