Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms