Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms