Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BPIFA3Q9BQP9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms