Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HINFPQ9BQA5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HINFPQ9BQA5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms