Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms