Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPAN18Q96SJ8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms