Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms