Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms