Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms