Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNSTQ6PJW8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNSTQ6PJW8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms