Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms