Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM259Q4ZIN3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM259Q4ZIN3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms