Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHKAPQ2M3C7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms