Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEN1Q17RS7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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