Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP7Q16576 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms