Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CARTPTQ16568 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CARTPTQ16568 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms