Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SNAPC1Q16533 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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